序发凡卷一补养之剂六味地黄丸附桂八味丸知柏八味丸七宝美髯丹还少丹黑地黄丸虎潜丸天真丸三才封髓丹大造丸补天丸人参固本丸参乳丸天王补心丹孔圣枕中丹大补阴丸滋肾丸（又名通关丸）斑龙丸龟鹿二仙膏补火丸唐郑相国
自序序一序二序三序四序五凡例卷一·医学溯源养生稽古阴阳水火生克运气运气总论十二化五运歌十二支年六气歌流年起六气歌客气交日歌逐年主气歌逐年客气歌脏腑（附：腔子、脂膜）脏象应天地脏腑贵贱脏腑命名释义脏腑相
原序序卷之一麻疹骨髓赋（增朴）静远主人麻疹西江月（删订）麻证条目法旨用药要诀（删订）增订治麻问答捷要麻疹形式要旨证治秘诀麻疹证治大略括密斋治法大略括验麻色吉凶麻疹轻证麻疹重证麻疹不治证麻疹死证括应用药
简介序卷之一卷之二卷之三卷之四卷之五卷之六卷之七卷之八卷之九卷之十卷之十一卷之十二卷之十三卷之十四卷之十五卷之十六卷之十七卷之十八卷之十九卷之二十丹波元胤跋
序序例第一案~第九案第十案~第十九案第二十案~第二十九案第三十案~第三十九案第四十案~第四十九案后记
题辞卷之一天道部天地阴阳大论其气三论六节五制生五论正六气说为运为气五六说五运说司天说地上三阴三阳说天道或问五则天道六气中见论地理六节位下六承论辨君火以明兼退行一步不司气化论卷之一人道部人道大阴阳疏心肾
序卷第一述增损旧方用药犯禁决述旧方合药法述看方及逆合备急药决治胸痹诸方治胸胁痰冷气满诸方治心痛腹胀满冷痛诸方治下利诸方治咳嗽上气诸气治气逆如奔豚状并诸汤方治虚满水肿诸方卷第二治头面风（论杂风状）诸方治
诸病主病诗
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简介序略言存济堂药局修合施送方并加药法