素问上古天真论篇第一四气调神大论篇第二生气通天论篇第三金匮真言论篇第四阴阳应象大论篇第五阴阳离合论篇第六阴阳别论篇第七灵兰秘典论篇第八六节藏象论篇第九五藏生成篇第十五藏别论篇第十一异法方宜论篇第十二移
明目论看眼诀图眼病歌诀冷眼歌诀热眼歌诀药性光明赋五经虚泻五经火眼目虚实冷热论点药药性炮炼法男女禁忌看眼法演药法点药法制药法煎膏法研药法合药法用药法服药法禁忌主药方辅药方加减方按五轮治疗捷法四季加减煎药
序一序二序三卷之一初诞第一问护养法第二问噤风撮口脐风第三问脉法第四问（无方）变蒸第五问五脏所主第六问（无方）五脏病证第七问（无方）肝脏第八问心脏第九问脾脏第十问卷之二肺脏第十一问肾脏第十二问面上证气色
医经小学
谢氏《发背对口治诀论》序总论附∶谢氏外科秘法附∶对口方附∶杨州存济堂药局膏药方
内外伤辨惑论
伤寒论注释
吴序张序自序张声驰序卷上人身一小天地论阴阳互根论五行生克论阴阳治法大要论枢机论卫气行度一经星经天论营气行度一经水行地论百病提纲论望病须察神气论卷中闻声须察阴阳论问证求病论切脉源流论内伤大要论湿气论卷下
序序二附录十二经见证不治已病治未病亢则害承乃制审察病机无失气宜能合色脉可以万全治病必求于本卷一中风一中寒二（附伤寒、伤风）中暑三（附暑风、注夏）中湿四瘟疫五（附大头天行病）火六卷二斑疹七疟八痢九泄泻十
原序本草从新凡例药性总义卷一草部山草类人参珠儿参党参土人参西洋人参北沙参空沙参甘草黄精萎蕤黄野白术种白术苍术桔梗天麻秦艽柴胡前胡独活羌活防风升麻细辛远志金毛狗脊淫羊藿巴戟天琐阳肉苁蓉白芨三七地榆丹参元